此级别处理的实验对象对人和动植物的危害较低，并且不具有对健康的人和动植物致病的危害因子，一般用于较为基础的教学和研究，例如部分学校会配有教学使用的生化实验室，研究非感染性的埃西里氏大肠杆菌，以及对于非传染性的病菌与组织进行培养或进行简单的教学等，不过需要规范的操作。

处理的实验对象相较于一级是有中等危害程度或有潜在危险的致病因子，所以二级实验室配有有效的防护和治疗措施，并且个人配有实验室防护服，眼睛、面部、手也均有防护，必要的时候也要配上呼吸防护，而且限定特定人员进出。二级实验室主要用于诊断，也有对一些对人体仅造成轻微的疾病，或在实验室空气中难以生存的病菌和病原体，其中便有艾滋病毒。

三级实验室也被称为防护实验室，它是在二级生物安全水平上增加了特殊的防护服，各个方面的防护程度都上升，适合进行临床诊断、科研以及生产药物，在人员的进出管理上严格把控，并且实验室的通风平衡配有定向气流进入实验室，而且实验室内的废气需要经过严格的过滤才能排放到室外，所有涉及感染性研究对象的操作过程都要在生物安全柜中进行，处理的对象也是对人和动植物有着危害的致病因子，实验人员也要规范操作，对应不同的处理的对象，需要进行对应的特殊操作等。